أكد الدكتور خالد عبد الغفار، وزير التعليم العالي والبحث العلمي، أن الوزارة تعمل على قدم المساواة وبحيادية كاملة في موضوع جامعة النهضة، قائلا: "شكلنا لجنة تقصي الحقائق ووصل لنا تقرير من مستشار الوزير ورئيس الجامعة ولم نستمع لممثل الطلاب واللجنة ستجتمع مع الطلاب أيا كانت الطلبات، وسيتم التعامل مع الطلبات في الإطار الشرعي ومَن يخرج عن ذلك سيتم التعامل معه بالقانون".

وأضاف عبدالغفار، في تصريحات صحافية الخميس على هامش اجتماع المجلس الأعلى للجامعات، أن الوزارة تتولى التحقيق في هذا الأمر ومعاملة المخطئ بالقانون، مشيرا إلى أن الموضوع رهن التحقيق وما تسفر عنه لجنة تقصي الحقائق سيتم إعلانه، قائلاً: "الحديث عن زيادة المصروفات عن 10% غير صحيح فلم ولن تتم زيادة المصروفات عن 10% وما تم الاتفاق عليه في مجلس الجامعات الخاصة تم تطبيقه بالفعل".

وعلق وزير التعليم العالي على اعتراض بعض الطلاب على البصمة الإلكترونية التي تطبقها جامعة النهضة في موضوع الانصراف والحضور قائلا: "غير مقبول أن طالبا يتدخل في النظام الداخلي للجامعات والجامعات مستقلة في ذلك، واللي يدور على كده مش عاوز ينتظم، واحترم كل جامعة في ما تراه من وضع النظام وليس من حق الطالب أن يتدخل في هذا الموضوع كل له حقوق وواجبات، وما يحدث الآن يذكرنا بوقت معين مضى ولن يعود مرة أخرى ومش هيحصل تاني والشرع والقانون يحكم العلاقة بين الطالب والأستاذ وأي تجاوز نحاسبه، وفي إنجلترا بيعاقبوا من يكتب بالتباشير على الحائط والكل لا بد أن يعرف حقوقه وواجباته".