على الرغم من الدور المهم الذي تقوم به القابلات في برامج صحة الأم في أوغندا، فأنهن يواجهن العديد من التحديات والمصاعب ومنها نقص التدريب وعدم ملائمة المنشآت وضعف الاجور. ووفقا لتقرير حديث صادر عن مؤسسة الأبحاث الطبية الإفريقية، فإن 38\% فقط من عدد القابلات في أوغندا 957ر11 قابلة إما مسجلات أو لديهن شهادة جامعية، على الرغم من أنهن يقمن بما نسبته 80\% من جميع حالات الولادة في المناطق الحضرية في البلاد و 37\% من جميع حالات الولادة على مستوى البلاد. وقالت قابلة في منطقة "سوروتي" الريفية -في مقابلة صحفية- إن العديد من القابلات يبذلن جهدا مضاعفا لمساعدة النساء في الولادة، مؤكدة نقص الامكانيات في المراكز الصحية من كهرباء وماء والتجهيزات الطبية الاساسية، ومشيرة إلى أنها اضطرت ذات مرة لاستخدام كشاف الاضاءة الصغير في الهاتف المحمول للمساعدة في إضاءة المكان أثناء عملية ولادة. وكان تقرير صادر عن الامم المتحدة قد أشار بأن النظام الصحي في أوغندا "غير داعم" للقابلات، للاجور المنخفضة وضعف البنية التحتية للخدمات الصحية، ونقص المعدات والإمدادات الأساسية.