يعتمد الفرق بين تقشير البشرة المنزلي وتقشير البشرة الطبي على عمق التقشير، في حين أن تقشير البشرة المنزلي هو اكثر سطحي، يعتبر تقشير البشرة الطبي علاج تقشير عميق. فهو يخترق الطبقات العميقة للجلد، الأمر الذي يتطلب احيانا تنفيذه تحت التخدير وحتى الاستشفاء. الفرق الاخر هو بنوعية المادة المستخدمة . وفي حين أن تقشير البشرة الطبي هو تقشير كيميائي، يتم فيه استخدام احماض كيميائية مختلفة، يكون التقشير المنزلي تقشير كيميائي بتركيز منخفض للمواد أو من الممكن أن يعتمد على النباتات، الحليب والخضار. تغذي هذه المنتجات البشرة وتمنحها النعومة، وتشجع على استبدال الخلايا وتجعل ملمسها ناعما. وعلى الرغم من اعتبار طرق تقشير البشرة غير خطيرة، لكن يجب الاخذ بعين الاعتبار أن علاج تقشير البشرة قد يسبب الضرر لذوي البشرة الفاتحة واللذين لا يناسبهم علاج تقشير البشرة. ومن الممكن حدوث عدوى في حال تنفيذ التقشير بطريقة غير مهنية، وندوب صعبة بالبشرة بالمقابل يمنع استخدام تقشير البشرة المنزلي لمن يعانون من البشرة الحساسة، النساء الحوامل، المرضعات، ومن يعانون من فرط احمرار البشرة.