"جوارديولا تسلم فريق بايرن ميونيخ وهو في أحسن الأحوال بعد تتويجه بالثلاثية، لذلك كان عليه السير على نفس النهج وإدخال تغيرات بسيطة على الفريق"، بهذا الكلام عبر فيلكس  ماجات  مدرب البايرن السابق عن الحالة التي وصلت اليها العلاقات بين جوارديولا و لاعبيه  ويضيف ماجات أن جوارديولا تسبب في خلق نوع من الفوضى وعدم الاستقرار في الفريق البافاري بسبب قراراته الخاصة بتشكيلة الفريق، معتبرا أن مثل ذلك أمرا خطيرا.

حالة عدم الرضى هذه تؤكدها أيضا الأنباء الواردة من محيط النادي البافاري، آخرها المشادة الكلامية التي دارت بين المهاجم توماس مولر وبيب جوارديولا خلال إحدى التدريبات  صاح  بيب في وجه مولر وهو ما لم يرق لهذا الأخير الذي رد بدوره بصوت عال على مدربه، و  غضب جوارديولا من رد فعل مولر ورمى بكرة كانت في يده في المرمى وأوقف التدريبات، مولر تصرف بعد ذلك بحكمة، حيث توجه إلى جوارديولا وقال له: "حسنا أيها المدرب، لقد أخطأت ".

وليست هي المرة الأولى التي يدخل فيها هداف كأس العالم 2010 في مشادات كلامية مع بيب جوارديولا، بل إن مولر عبر مرارا عن امتعاضه من قيام غوارديولا بتغييرمهامه في المباريات المهمة حتى وإن كان أداؤه جيدا على أرض الملعب، كما جرى في ذهاب نصف نهائي دوري أبطال أوروبا الموسم الماضي أمام برشلونة، حيث رد مولر على استبداله في الدقيقة 79 بالقول: "هل سيتوقف هذا الهراء أخيرا".

إلى جانب توماس مولر يعاني ماريو جوتسه مع جواريولا، فصاحب هدف الفوز في نهائي مونديال البرازيل تحول من لاعب أساسي في الفريق إلى احتياطي لا يلعب سوى لدقائق معددوة، وقد اثار هذا الأمر حفيظة وكيل أعمال جوتسه، معتبرا أن المدرب بيب جوارديولا بصدد تدمير موهبة غوتسه، وأضاف فولكر شتورس فى تصريحات:جوتسه انتقل إلى بايرن ميونيخ من أجل لعب المباريات الكبرى والمهمة، ولكن "قرارات جوارديولا سوف تدمره".

ويحذر الخبراء من أن بايرن ميونيخ قد يندم على ضياع موهبة كروية كبيرة مثل جوتسه إذ انتقل إلى فريق آخر وتألق فيه على غرار ما يحدث حاليا مع لاعب خط الوسط توني كروس.

التصريحات الأخيرة التي أدلى بها المدرب الكتالاني بخصوص شفاينشتايجر كانت أيضا بعيدة كل البعد عن مفهوم الدعم غير المحدود الذي يقدمه مدربون آخرون للاعبيهم، جوارديولا أكد في حوار صحفي تزامن مع انطلاق استعدادات بايرن ميونيخ للموسم المقبل، بأنه يرحب ببقاء شفاينشتايجر في الفريق لكنه لم يعبر بوضوح عن تشبثه به أو عن ضرورة بقائه، كأن يقول مثلا: "شفاينشتايجر سيبقى معنا أو عليه أن يبقى معنا"، فمثل هذه التعبيرات تسعد اللاعب وتجعله يعيد التفكير في وجهته المستقبلية.

وإلى جانب العلاقة المتوترة لجوارديولا مع بعض اللاعبين، ظهر توتر أيضا بين مدرب بايرن  ميونيخ وطبيب الفريق، حيث حمل جوارديولا هانز فيلهلم مولر مسؤولية غياب لاعبين بسبب كثرة الإصابات التي تعرض لها لاعبو بايرن في الموسم الماضي، وهو ما دفع بالطبيب الألماني للاستقالة من منصبه بعد أكثر من 40 عاما قضاها على رأس الطاقم الطبي للفريق البافاري.