كشف التّقرير المبدئيّ لخبراء المعمل الجنائيّ في مديرية أمن الأقصر أنّ سبب الحريق الذي شبّ في الباخرة السّياحيّة نايل بايونير 2 في السّاعات الأولى من صباح الجمعة هو التّخزين الخاطئ وعدم التّهوية للأغطية والمفروشات التي تحتوي على ألياف صناعية مما أدى لاشتعالها ذاتيّا. وكان مدير أمن الأقصر اللواء مصطفى بكر ومساعد وزير الداخلة لشرطة السياحة والآثار اللواء ممتاز فتحي تلقيا إخطارا من مساعد مدير الإدارة العامة لشرطة السياحة والآثار لقطاع الصعيد اللواء مدحت النادي باشتعال النيران في الساعات الأولى من صباح الجمعة في الباخرة السياحية نايل بايونير 2 أثناء رسوّها في مرسى وزارة السياحة في مدينة الأقصر  وهى خالية من السياح ، حيث اشتعلت النيران في مخزن للمفروشات في الطابق الثاني وامتدت للطابق الثالث، ونجحت جهود رجال لحماية المدنية والإنقاذ من تعويم الباخرة بعيد عن بقية البواخر الملاصقة لها والسيطرة على النيران ومنع امتدادها لبقية الباخرة واقتصار الحريق على مؤخرة الباخرة مما قلل من حجم الخسائر. وقال مفتش شرطة السياحة والآثار في الأقصر العميد حسني حسين إن الباخرة متوقفة عن العمل منذ 8 شباط/فبراير الجاري، لعدم وجود نزلاء عليها.  وبدأت نيابة قسم الأقصر بإشراف المحامي العام لنيابات المحافظة المستشار  عماد وليد البيلي تحقيقاتها في الحادث.